有效防止工程款拖欠问题的方式是当事人把好业主资金审查、把好工程造价以及把好索赔等。工程款合同的诉讼时效是三年，自权利人知道或者应当知道之日起计算。
一、
如何有效防止工程款拖欠问题
有效防止工程款拖欠问题的方式如下：
1.把好业主资金审查关。积极介入建设单位资信的审查，做到未雨绸缪。监理工程师的选择对承发包双方均有重要意义。
2.把好工程造价关。工程款结算难，一个重要问题是出在工程造价环节。过去较长时期，建筑工程款结算大都是以承、发包方委托审价单位，如中国建设银行审定的最终造价为依据；并同时，各级政府公布有详细的收费定额标准，随时根据市场变动进行调整，可作为审价通行标准。
3.把好索赔关。施工合同中的索赔，指承包人在合同履行过程中，对并非由于自己的过错，并且属于应由发包人承担责任的情况所造成的实际损失，凭有关证据提出的给予补偿的要求，包括要求经济补偿和工期延长两种形式。
二、
工程款合同的诉讼时效是多久
工程款合同的诉讼时效是三年，从知道或应当知道拖欠行为起算。我国法律规定诉讼时效可以通过一定的主张权利行为得以中断，中断后诉讼时效可以重新计算。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条 【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
三、
拖欠工程款导致停工可以要求支付停工的费用吗
按照国家法律规定，有以下几种原因而造成的工程停工，施工方有权向业主提出停工索赔。
1.因为业主单方终止施工合同而造成的工程停工。
2.因为业主资金原因而造成的工程停工，即在工程施工过程中工程进度款不能正常支付。
3.因为业主意图使设计大面积变更或设计资料不全而造成的停工。
4.因为战争、地震等其它不可抗拒因素而造成的工程停工。