处理医疗事故纠纷的法律程序是由当事人先行协商沟通，若能达成协商一致的便可以签订协议约定，若是无法达成协商的，再向卫生行政部门提起调解申请，或是向法院提起诉讼。
一、
处理医疗事故纠纷的法律程序有哪些
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决;不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。对医疗事故的确认和处理有争议时，提请地市医学会进行鉴定，由卫生行政部门处理。
对医疗事故技术鉴定专家组所做的结论或者对卫生行政部门所做的处理不服的，病员及其家属和医疗单位均可在接到结论或者处理通知书之日起15日内，向上一级医疗事故技术办公室共同申请再次鉴定，或者向上一级卫生行政部门申请复议，也可以直接向当地人民法院起诉。
二、
医疗事故纠纷可以直接起诉吗
医疗事故纠纷可以直接起诉。找法网提醒，发生医疗事故后，当事人可以和医疗机构协商解决，也可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，还可以直接向人民法院提起诉讼。
《医疗事故处理条例》第四十条，当事人既向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，又向人民法院提起诉讼的，卫生行政部门不予受理；卫生行政部门已经受理的，应当终止处理。
第四十六条，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。
三、
医疗事故的处理原则是什么
医疗事故的处理原则是遵循过错责任原则，也就是如果说医疗事故的相关的医生和医务人员没有存在着过错的话，那么是不需要承担相应的责任的，主要还是因为这样进行判断的话，才是有利于相关人员的，才是公平公正的。出了医疗事故，我们先要看看是否需要承担一定的民事责任，也就是这个事故的责任应该由谁来承担，那么在处理起来就要遵循一定的原则。